Thèse: Effet d'un transfert du microbiote fécale sur les atteintes épithéliales radio-induite du côlon de rat. La radiothérapie représente 60 % des stratégies thérapeutiques du cancer de la région pelvienne. Les conséquences de l'irradiation dans les tissus entourant la tumeur peuvent apparaître plusieurs années après la radiothérapie. Ceci a été décrit en 2010 comme une nouvelle pathologie : la "Pelvic Radiation Disease". Au laboratoire, l'objectif est de développer de nouvelles stratégies thérapeutiques pour réduire la toxicité tissulaire induite par la radiothérapie. Des données cliniques prospectives ont démontré que pendant et après la radiothérapie pelvienne, il y a un changement dans le microbiote en parallèle des complications intestinales. Ceci pourrait être décrit comme une dysbiose, une perturbation de la relation de symbiose entre l'hôte et le microbiote intestinal. Notre objectif est d'attester, dans un modèle préclinique pertinent, que l'irradiation conduit à des modifications de l'écosystème intestinal qui in fine est responsable de l'évolution des lésions. Nous avons développé un modèle d'irradiation localisée approprié utilisant des doses fractionnées (très similaires à la procédure clinique) pour obtenir des protocoles d'irradiation qui induisent des dommages épithéliaux modérés ou sévères. En collaboration avec l'Institut national de recherche agronomique et environnementale, nous avons analysé la dynamique temporelle (i) de l'altération du microbiote fécal (séquençage métagénomique Shot Gun) et du métabolome (méthodes analytiques basées sur la chromatographie liquid couple à de la spectrométrie de masse) et (ii) de la réponse immunitaire et épithéliale de l'hôte par immunomarquage. Nous avons rapporté qu'en fonction du protocole utilisé, l'irradiation augmente la diversité du microbiote, stimule la réponse immunitaire de l'hôte et altère les tissus au fil du temps. Nous avons également démontré que le transfert de microbieote fécale réduit la toxicité colique uniquement chez les animaux présentant des dommages épithéliaux modérés. Les traitements existants pour la PRD ne sont que symptomatiques, c'est pourquoi cette étude est d'un intérêt clinique primordial.